همتای تاریک موترا یعنی باترا، ظهور می‌کند تا به نمایندگی از زمین، بشریت را نابود کند. دو پری کوچک به نام کازموس با فراخواندن موترا برای مبارزه با این موجود، کمک خود را ارائه می‌دهند. متأسفانه یک شهاب‌سنگ باعث بیدار شدن گودزیلای در حال خواب زمستانی شده و نبردی سه‌جانبه برای بقای زمین آغاز می‌شود.

سال ۱۹۸۲ است و مکان، شونان در استان کاناگاوای ژاپن. گروهی از جوانان پرشور یک ایستگاه رادیویی ساحلی را برای جامعه محلی اداره می‌کنند.